More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1292 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1292  Survival protein SurE  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0271  stationary-phase survival protein SurE  59.16 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.848297  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2355  stationary-phase survival protein SurE  57.63 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0835343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1422  stationary-phase survival protein SurE  58.08 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2394  stationary-phase survival protein SurE  52.65 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1478  stationary-phase survival protein SurE  48.68 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2324  stationary-phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0373  5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.94 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  36.3 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  34.55 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  33.57 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  37.14 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  33.94 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  32.95 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  34.24 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  32.85 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  31.35 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  33.6 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  33.6 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.71 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  29.92 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  35.46 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  30.42 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  30.83 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  30.42 
 
 		 261 aa  95.9  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  34.52 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  30.74 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  32.27 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  35.06 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  30.35 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.56 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  29.23 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  32.17 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  27.45 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  27.45 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  33.45 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  35.11 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  34.52 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  32.29 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  30.34 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  44.88 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  32.29 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  30.34 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  30.34 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  35.18 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  34.51 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  31.87 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  33.09 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  32.42 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  34.94 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  31.76 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  32.53 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  46.62 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  46.62 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  33.86 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  27.86 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  32.54 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  32.02 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  31.75 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  33.6 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  32.08 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  45.11 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  32.67 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0876  stationary phase survival protein SurE  42.22 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280564  hitchhiker  0.0000231421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>