More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0271 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0271  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.848297  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2355  stationary-phase survival protein SurE  70.57 
 
 
263 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0835343  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1422  stationary-phase survival protein SurE  63.06 
 
 
268 aa  310  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2394  stationary-phase survival protein SurE  57.78 
 
 
274 aa  291  9e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1292  Survival protein SurE  59.16 
 
 
271 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1478  stationary-phase survival protein SurE  47.04 
 
 
278 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2324  stationary-phase survival protein SurE  41.73 
 
 
296 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
263 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
260 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
247 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  34.14 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  34.52 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  37.22 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 
264 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
264 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.68 
 
 
250 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  34.14 
 
 
279 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.09 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  37.36 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  36.12 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  33.21 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 
248 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  35.69 
 
 
265 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 
252 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  34.26 
 
 
252 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  31.77 
 
 
261 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 
263 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  34.47 
 
 
260 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  33.6 
 
 
247 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  36.95 
 
 
272 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
252 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
249 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
253 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  34.17 
 
 
259 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
255 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  32.96 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  32.78 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 
253 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  32.96 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  35.75 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  27.92 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  36.87 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  37.22 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  30.95 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.19 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.66 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  32.94 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  33.82 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  30.51 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  33.7 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  34.47 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  36.67 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  34.02 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  33.21 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  33.47 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  31.75 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  31.82 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  45.97 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.78 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  31.06 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  32.97 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  32.96 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  31.98 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  34.43 
 
 
257 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  32.94 
 
 
259 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  33.71 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  31.35 
 
 
254 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  32.05 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  32.44 
 
 
277 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  32.06 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  31.45 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  30.8 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  46.09 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  30.5 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  32.8 
 
 
260 aa  92  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.71 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.71 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  35.63 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  32.8 
 
 
280 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  30.56 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1774  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00468651  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  31.06 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  33.83 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>