More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0491 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0491  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0551134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  36.5 
 
 
264 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  37.82 
 
 
258 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  33.76 
 
 
259 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  34.4 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  34.2 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  34.78 
 
 
259 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  33.46 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  33.46 
 
 
273 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 
263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  34.09 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  30.8 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
260 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  33.6 
 
 
254 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  31.6 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  33.59 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  43.61 
 
 
277 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  35.34 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  32.39 
 
 
259 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  32.39 
 
 
259 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  32.39 
 
 
259 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  31.37 
 
 
252 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  32.58 
 
 
253 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  32.39 
 
 
254 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  33.87 
 
 
259 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  33.33 
 
 
260 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  31.4 
 
 
253 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
265 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  32.96 
 
 
252 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  31.08 
 
 
287 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  32.81 
 
 
273 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  31.89 
 
 
281 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  31.89 
 
 
281 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  44.78 
 
 
257 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  34.75 
 
 
265 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  48.89 
 
 
252 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  31.58 
 
 
253 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  32.95 
 
 
261 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.19 
 
 
258 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  30.25 
 
 
252 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  36.16 
 
 
264 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  32.52 
 
 
259 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  30.68 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.87 
 
 
258 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  32.95 
 
 
261 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  31.8 
 
 
255 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  32.67 
 
 
263 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  34.09 
 
 
264 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  37.02 
 
 
259 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 
250 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  43.7 
 
 
258 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 
256 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  31.5 
 
 
255 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  31.47 
 
 
258 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  39.66 
 
 
293 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  33.21 
 
 
244 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  31.97 
 
 
252 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
254 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 
251 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  44.27 
 
 
264 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  32.14 
 
 
258 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  33.08 
 
 
255 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  47.1 
 
 
261 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  32.23 
 
 
269 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  31.58 
 
 
253 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  31.05 
 
 
255 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  32.67 
 
 
249 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  43.06 
 
 
262 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  35.53 
 
 
259 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  30.04 
 
 
250 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 
269 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  37.99 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  43.06 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  30.71 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  42.75 
 
 
257 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  32.64 
 
 
255 aa  99.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  45.04 
 
 
252 aa  99  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  36.05 
 
 
259 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  35.6 
 
 
251 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  30.33 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2128  stationary phase survival protein SurE  34.45 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  45.52 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2176  stationary phase survival protein SurE  34.45 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  32.3 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  30.33 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  46.38 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  32.14 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  32.14 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  31.87 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  31.87 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>