215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27967 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_27967  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
485 aa  985    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.569806  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06870  MATE efflux family protein (Eurofung)  27.2 
 
 
507 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  25.27 
 
 
456 aa  100  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00581  MATE efflux family protein (Eurofung)  25.91 
 
 
622 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29306  predicted protein  27.25 
 
 
483 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1006  MATE efflux family protein  33.65 
 
 
469 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
478 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0948  MATE efflux family protein  33.17 
 
 
464 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  25.22 
 
 
456 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
470 aa  90.1  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1009  MATE efflux family protein  33.17 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54310  predicted protein  21.92 
 
 
606 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0389645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
460 aa  87  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  27.78 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  24.44 
 
 
471 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  26.77 
 
 
457 aa  84  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  24.7 
 
 
471 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  29.54 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  23.53 
 
 
460 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  29.64 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  25 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  29.64 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  25.84 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  29.64 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  24.63 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  24.9 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  24.9 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.61 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
486 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  22.95 
 
 
477 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  28.43 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  27.91 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  28.28 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  34.36 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  23.31 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  28.28 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  23.77 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  22.26 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  29.27 
 
 
458 aa  77  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_006686  CND03760  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 
763 aa  76.6  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  27.67 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  27.67 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  27.36 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  26.47 
 
 
468 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  27.95 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32724  predicted protein  22.42 
 
 
569 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  28.26 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  26.17 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  28.26 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  28.26 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  27.61 
 
 
457 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  29.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  24.61 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  22.3 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  28.93 
 
 
462 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  31.03 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  25.27 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  29.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  29.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  29.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  29.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  29.15 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  26.69 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  23.4 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  27.24 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  28.72 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  30.6 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  20.97 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  23.78 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  24.12 
 
 
453 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  30 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>