More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0253 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0253  ferric siderophore receptor protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  46.23 
 
 		 758 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  47.55 
 
 		 753 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  47.5 
 
 		 742 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 		 722 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  43.72 
 
 		 823 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  43.94 
 
 		 771 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  45.77 
 
 		 734 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  44 
 
 		 804 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  46.5 
 
 		 808 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  45.27 
 
 		 851 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  45.27 
 
 		 839 aa  168  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  45.27 
 
 		 879 aa  168  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  43.5 
 
 		 804 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  42.21 
 
 		 728 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  46.27 
 
 		 764 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 		 737 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 		 728 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  45.73 
 
 		 754 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 		 729 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  42.16 
 
 		 801 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  42 
 
 		 772 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  42 
 
 		 772 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  42.16 
 
 		 801 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  42.93 
 
 		 761 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 		 809 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  39 
 
 		 805 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  43.14 
 
 		 730 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 804 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  41.5 
 
 		 726 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  41.41 
 
 		 746 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  43.28 
 
 		 764 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 		 800 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  43.9 
 
 		 802 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  38 
 
 		 819 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  45.23 
 
 		 746 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 		 749 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  43.28 
 
 		 773 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  42.79 
 
 		 773 aa  155  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  40.91 
 
 		 725 aa  154  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 768 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  41.5 
 
 		 762 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  41.71 
 
 		 759 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  40.2 
 
 		 737 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  41.62 
 
 		 720 aa  151  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  41.62 
 
 		 763 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  41.62 
 
 		 768 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 722 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  43.72 
 
 		 744 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  43.35 
 
 		 753 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 729 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  39.5 
 
 		 756 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 		 761 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  39.59 
 
 		 777 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 		 770 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  39.3 
 
 		 700 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  41.87 
 
 		 709 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 		 712 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 755 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  38.73 
 
 		 724 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 729 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  38.31 
 
 		 731 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  39.2 
 
 		 728 aa  131  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  35.5 
 
 		 730 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  35.32 
 
 		 804 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  33.96 
 
 		 727 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 811 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 811 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 714 aa  97.8  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 751 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 743 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 728 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 743 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 742 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 728 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 685 aa  92.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 698 aa  92  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 743 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 743 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 702 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 743 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 743 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.69 
 
 		 705 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 716 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 729 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 727 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 774 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 708 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 710 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 710 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 702 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 706 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 710 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 706 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 712 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 714 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 727 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 718 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>