78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2584 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  45.77 
 
 		 156 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  45.27 
 
 		 156 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  48.85 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  49.12 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  47.92 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  42.73 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  37.4 
 
 		 430 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  43.92 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  38.57 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  38.57 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  44.14 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  44.14 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  34.51 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  38.82 
 
 		 425 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  32.41 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1879  hypothetical protein  34.82 
 
 		 163 aa  66.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  40 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  38.71 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  34.51 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.48 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  32.95 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  31.48 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  34.83 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  41.18 
 
 		 316 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  31.87 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  29.67 
 
 		 296 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  29.67 
 
 		 286 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  29.67 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  35.71 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  35.71 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  33.94 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  43.86 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  30.19 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  43.1 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  29.25 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  36.47 
 
 		 219 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  46.55 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  46.55 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  49.06 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  29.17 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  54.55 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  54.55 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  32.95 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  32.69 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  54.55 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  28.89 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  28.89 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  46.3 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  42.22 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  34.43 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  34.38 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  52.27 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  52.27 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  52.27 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  52.27 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  52.27 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  52.27 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  52.27 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  52.27 
 
 		 208 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2289  17 kDa surface antigen  38.37 
 
 		 192 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.0439571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>