52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1259 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  100 
 
 		 163 aa  329  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  36.6 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  40.19 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  35.24 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  34.58 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  34.27 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  34.31 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  33.83 
 
 		 296 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  33.83 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  31.01 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  37.5 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  33.77 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  32.99 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  32.33 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  32.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  32.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  34.09 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.42 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  25.76 
 
 		 266 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  32.95 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  44.9 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  34.15 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  28.48 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  32.22 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  28.41 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  29.55 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  31.43 
 
 		 425 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  29.03 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  30.12 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  27.72 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  27.22 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  27.22 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  31.33 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  31.13 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  31.53 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  29.47 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  30.5 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1304  hypothetical protein  25.41 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  25.87 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  31.17 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  25.64 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  26.32 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  30.53 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  29.21 
 
 		 141 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  34.62 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0904  hypothetical protein  28.69 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342702  normal  0.115117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3303  conserved hypothetical protein; putative exported protein  28.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3627  hypothetical protein  28.71 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>