33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1390 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  75.74 
 
 		 136 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  78.52 
 
 		 164 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  70.29 
 
 		 174 aa  202  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  72.06 
 
 		 132 aa  193  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  66.92 
 
 		 128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  60.58 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  37.01 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  32.14 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  32.84 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  38.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  37.66 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.67 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  29.91 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  29.6 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  35.71 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  32.47 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  37.5 
 
 		 425 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  36.11 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  30.61 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  31.51 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  31.33 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  34.94 
 
 		 165 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1024  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0593  hypothetical protein  27.61 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  31.65 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  27.86 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>