36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1206 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  89.63 
 
 		 136 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  68.97 
 
 		 174 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  78.52 
 
 		 136 aa  227  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  71.85 
 
 		 132 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  70.16 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  61.31 
 
 		 134 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  37.06 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  32.12 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  31.85 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  38.33 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  32.35 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.67 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  38.33 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  29.77 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.06 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  35.71 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  31.94 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  31.33 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  37.5 
 
 		 425 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  32.53 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0593  hypothetical protein  27.42 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  31.17 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  30.86 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0633  hypothetical protein  27.42 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0725  hypothetical protein  29.75 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  34.94 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  35.8 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>