37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0311 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  100 
 
 		 425 aa  855    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  49.53 
 
 		 156 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  43.4 
 
 		 156 aa  99.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  47.19 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  47.19 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  44.83 
 
 		 153 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  39.42 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 162 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  40.43 
 
 		 165 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  38.82 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  37.86 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  33.68 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  36.9 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  36.9 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  35.05 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  35.48 
 
 		 173 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  33.66 
 
 		 151 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  34.41 
 
 		 168 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  35.42 
 
 		 150 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  43.86 
 
 		 134 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  43.66 
 
 		 144 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  39.29 
 
 		 136 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  39.02 
 
 		 141 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4031  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  32.94 
 
 		 163 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  31.65 
 
 		 174 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3627  hypothetical protein  27 
 
 		 129 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3303  conserved hypothetical protein; putative exported protein  27 
 
 		 129 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  39.29 
 
 		 132 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  28.26 
 
 		 140 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  37.21 
 
 		 158 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  40.3 
 
 		 148 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>