18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5836 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  320  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  96.84 
 
 
158 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  65.5 
 
 
170 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  54.23 
 
 
285 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  54.23 
 
 
285 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  54.23 
 
 
285 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  52.11 
 
 
285 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  53.52 
 
 
161 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  52.82 
 
 
237 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  51.39 
 
 
153 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  52.04 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  52.59 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  56.18 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  47.37 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  39.05 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  46.75 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  53.12 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  53.12 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>