16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2710 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  100 
 
 		 146 aa  290  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  52.87 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  44.54 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  54.12 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  45.37 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  45.32 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  44.44 
 
 		 285 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  44.44 
 
 		 285 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  44.44 
 
 		 285 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  45.37 
 
 		 237 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  45.65 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  54.05 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  43.94 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  56.63 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  44.09 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  35.95 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>