16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1771 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  286  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  52 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  50.59 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  50 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  48.62 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  45.07 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  52.86 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  53.03 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  45.07 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  43.66 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  43.66 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  43.66 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  46.48 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  45.07 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>