16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1668 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  100 
 
 
155 aa  314  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  74.17 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  47.17 
 
 
285 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  47.17 
 
 
285 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  47.17 
 
 
285 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  47.17 
 
 
285 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  54.63 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  48.48 
 
 
237 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  43.86 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  48.48 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  46.9 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  44.25 
 
 
158 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  41.07 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  50.59 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  47.42 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  56.16 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>