17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2782 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  77.3 
 
 
155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  53.27 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  51.43 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  59.74 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  44.34 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  53.33 
 
 
285 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  53.33 
 
 
285 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  53.33 
 
 
285 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  53.33 
 
 
285 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  53.33 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  53.33 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  47.96 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  59.46 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  43.14 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  54.17 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  41.82 
 
 
425 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>