17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4962 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4962  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  354  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2710  lipoprotein  44.23 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0702345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1668  putative lipoprotein  48.45 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178246  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5836  hypothetical protein  40.4 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714865  normal  0.360739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0066  hypothetical protein  39.29 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1707  putative lipoprotein  45.57 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2782  putative lipoprotein  45.36 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3489  hypothetical protein  39.39 
 
 
285 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1819  hypothetical protein  39.39 
 
 
285 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.951462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0079  hypothetical protein  40.4 
 
 
285 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2734  hypothetical protein  39.39 
 
 
285 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6062  hypothetical protein  39.18 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0290  hypothetical protein  40.4 
 
 
237 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0078  hypothetical protein  40.4 
 
 
161 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1771  hypothetical protein  48.94 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7687  hypothetical protein  34.95 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  36.84 
 
 
425 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>