43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1122 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 430 aa  841    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  46.15 
 
 		 156 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 156 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  38.53 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  38.05 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  37.01 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  37.01 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  39.81 
 
 		 151 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  36.3 
 
 		 150 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  44.32 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  44.32 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  43.22 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  45.1 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  50.7 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  33.54 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  39 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  27.83 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  33.94 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  40.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  40.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  22.86 
 
 		 3242 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  24.79 
 
 		 331 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  33.59 
 
 		 9529 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24245  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  23.2 
 
 		 2378 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175257  decreased coverage  0.00602767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 657 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  26.04 
 
 		 1458 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  33.33 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  25.41 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  28.8 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.19 
 
 		 903 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  22.97 
 
 		 1347 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1143 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  22.97 
 
 		 1347 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  29.81 
 
 		 794 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  25 
 
 		 1782 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2778  hypothetical protein  30.67 
 
 		 184 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.832205  normal  0.295065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  27.52 
 
 		 1660 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1058  hypothetical protein  23.68 
 
 		 746 aa  43.5  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  32.29 
 
 		 168 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1246 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  41.27 
 
 		 154 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2289  17 kDa surface antigen  31.4 
 
 		 192 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.0439571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  38.36 
 
 		 141 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>