84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0626 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  58.28 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  39.35 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  40.79 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  44.12 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  51.68 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  34.75 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  43.12 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  41.13 
 
 		 430 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  37.04 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  35.14 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  35.14 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  36.94 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  36.26 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  42.2 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  34.45 
 
 		 285 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  35 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  33.66 
 
 		 425 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  35.23 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1879  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  29.67 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  28.18 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  29.67 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  28.18 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  30.77 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  29.17 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  31.94 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  31.94 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0944  17 kDa surface antigen  27.87 
 
 		 346 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2778  hypothetical protein  31.97 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.832205  normal  0.295065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  31.91 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  44.9 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  29.73 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  56.1 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  44.9 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  51.22 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  34.21 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  35.38 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  50 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  28.38 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  35.14 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  38.55 
 
 		 177 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  52.5 
 
 		 175 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  47.73 
 
 		 204 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  47.73 
 
 		 206 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  45.45 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 216 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  25.37 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  45.45 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  28 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  47.73 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  45.45 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  27.91 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  27.66 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0904  hypothetical protein  28.74 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342702  normal  0.115117 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  39.29 
 
 		 257 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1280  hypothetical protein  32.86 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  39.29 
 
 		 257 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0442  17 kDa surface antigen  40.28 
 
 		 87 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>