27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1280 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1280  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1314  hypothetical protein  99.22 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0791158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1381  hypothetical protein  91.41 
 
 		 128 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0921  hypothetical protein  91.41 
 
 		 128 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1403  hypothetical protein  91.41 
 
 		 128 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4547  hypothetical protein  90.62 
 
 		 128 aa  229  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1912  hypothetical protein  75.78 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226033  normal  0.369263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0890  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.952074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0699  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1652  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0774399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1809  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.40642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1417  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0461  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1631  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2667  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2831  hypothetical protein  45.04 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.675507  normal  0.0307835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1304  hypothetical protein  46.67 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6439  hypothetical protein  47.93 
 
 		 134 aa  103  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0904  hypothetical protein  41.22 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342702  normal  0.115117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4031  hypothetical protein  29.77 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1706  hypothetical protein  30.17 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  26.56 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3627  hypothetical protein  31.63 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3303  conserved hypothetical protein; putative exported protein  32.29 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  31.67 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3832  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000375961  normal  0.0175839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  31.94 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>