21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3832 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3832  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  258  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000375961  normal  0.0175839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  32.8 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4031  hypothetical protein  33.06 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1304  hypothetical protein  31.36 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2831  hypothetical protein  31.36 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.675507  normal  0.0307835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0904  hypothetical protein  31.09 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342702  normal  0.115117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6439  hypothetical protein  32.04 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1706  hypothetical protein  26.96 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00508842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3303  conserved hypothetical protein; putative exported protein  28.72 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3627  hypothetical protein  28.72 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1417  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0461  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1631  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1652  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0774399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0699  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2667  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1809  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.40642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0890  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.952074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1280  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1314  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0791158 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4547  hypothetical protein  28.42 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>