27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2831 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2831  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  266  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.675507  normal  0.0307835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1304  hypothetical protein  88.37 
 
 
129 aa  237  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0904  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342702  normal  0.115117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6439  hypothetical protein  58.54 
 
 
134 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1314  hypothetical protein  45.74 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0791158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0921  hypothetical protein  45.74 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1403  hypothetical protein  45.74 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1381  hypothetical protein  44.96 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1280  hypothetical protein  44.96 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4547  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1417  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0699  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1652  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0774399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1631  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0461  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0890  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.952074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1809  hypothetical protein  50.5 
 
 
128 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.40642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1912  hypothetical protein  49.07 
 
 
127 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226033  normal  0.369263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2667  hypothetical protein  43.51 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4031  hypothetical protein  27.87 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3832  hypothetical protein  32.35 
 
 
129 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000375961  normal  0.0175839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3627  hypothetical protein  30.21 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3303  conserved hypothetical protein; putative exported protein  30.21 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3091  hypothetical protein  33.66 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.892271  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1706  hypothetical protein  20.72 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00508842  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  31.53 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>