24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1706 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  268  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  43.22 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4031  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3303  conserved hypothetical protein; putative exported protein  30.39 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3627  hypothetical protein  30.39 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0921  hypothetical protein  31.9 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1403  hypothetical protein  31.9 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1381  hypothetical protein  31.9 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4547  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3832  hypothetical protein  27.45 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000375961  normal  0.0175839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1652  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0774399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0890  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.952074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0699  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2667  hypothetical protein  30.53 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1631  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0461  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1417  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1809  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.40642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1314  hypothetical protein  30.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0791158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1280  hypothetical protein  30.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6439  hypothetical protein  23.48 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0904  hypothetical protein  23.93 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342702  normal  0.115117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2831  hypothetical protein  20.72 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.675507  normal  0.0307835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1304  hypothetical protein  20.72 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>