21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3912 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  95.1 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  94.06 
 
 		 286 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  93.71 
 
 		 296 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  34.43 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1062  SH3 type 3 domain-containing protein  32.42 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  35 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  37.23 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  32.35 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00820  hypothetical protein  37.93 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0250  17 kDa surface antigen  23.46 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315994  normal  0.537403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001654  hypothetical protein  45.1 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  37.29 
 
 		 773 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  38.6 
 
 		 549 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  41.07 
 
 		 1067 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  38.6 
 
 		 553 aa  45.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  40.28 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  28.81 
 
 		 384 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.96 
 
 		 1049 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  33.77 
 
 		 165 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  28.81 
 
 		 384 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>