11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001654 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001654  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  554  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00820  hypothetical protein  68.3 
 
 		 263 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1062  SH3 type 3 domain-containing protein  40.28 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  45.1 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  45.1 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  45.1 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  45.1 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  34.55 
 
 		 549 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  30.28 
 
 		 1067 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  32.73 
 
 		 553 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  25.2 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>