44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2345 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  34.97 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  32.22 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  33.97 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0250  17 kDa surface antigen  38.58 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315994  normal  0.537403 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  42.57 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  42.2 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  38.96 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  37.97 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  41.18 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  43.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  35.24 
 
 		 150 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  58.54 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  58.54 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  58.54 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  58.54 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  29 
 
 		 879 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  37.8 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  38.33 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  37.8 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  38.33 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  34.67 
 
 		 1067 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  38.02 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  44.64 
 
 		 165 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.48 
 
 		 553 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  30.21 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001654  hypothetical protein  25.2 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>