62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0930 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 165 aa  323  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  63.69 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  60.61 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  49.7 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  48.61 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  42.68 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  45.74 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  37.04 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  42.31 
 
 		 430 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  36.54 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  36.15 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  35.85 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  42.55 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  35.98 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  35.98 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  42.39 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  39.13 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  40.43 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  41.3 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  39.77 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  38.46 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  35.23 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  32.22 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  39.02 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  33.93 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  34.26 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  34.26 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  28.79 
 
 		 296 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  29.46 
 
 		 285 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  29.23 
 
 		 286 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  32.67 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  36.56 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  44.64 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  30.25 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  28.46 
 
 		 286 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  45.24 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  43.75 
 
 		 263 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  28.99 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  49.02 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 272 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  34.94 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  28.87 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  52.27 
 
 		 215 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  52.27 
 
 		 215 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1879  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  49.02 
 
 		 208 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  52.27 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  34.92 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  34.52 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  28.09 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  28.09 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2289  17 kDa surface antigen  35.71 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.0439571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>