29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1361 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  56.62 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  55.15 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  52.74 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  44.53 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  44.62 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  44.62 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  49.43 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  36.15 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  40.48 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  38.39 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  35.96 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  36.56 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  35.48 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.48 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  32.14 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  32.08 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  41.43 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  33.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  35.23 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  35.23 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  28.97 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  36.92 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  36.92 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  30.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  31.87 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  32.22 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  38.81 
 
 		 430 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  31.76 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>