37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2128 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  76.87 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  77.78 
 
 		 173 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  69.15 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  51.39 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  62.37 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  45.57 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  38.54 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  34.04 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  33.11 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  33.12 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  32.37 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  41.3 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  41.3 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  29.45 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  35.56 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  40.24 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  35.96 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  34.26 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  27.17 
 
 		 266 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  36.26 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  34.25 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.14 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  36.14 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  36.14 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  28 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  33.75 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  33.75 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  32.61 
 
 		 425 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  27.78 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  32.5 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  30.59 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  30.59 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>