31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1087 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  43.61 
 
 		 219 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  42.07 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  46.08 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  46.08 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  45.1 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  30.95 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  32.14 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  31.85 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  29.5 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  28.89 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  29.1 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  38.04 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  31.25 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  41.46 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  33.58 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  35.11 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  33.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  25.34 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  27.33 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  22.81 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  23.74 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  37.5 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  29.79 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  30.43 
 
 		 142 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  23.02 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>