25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1107 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  43.61 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  36.63 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  35.58 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.63 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  32.12 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  37.93 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  32.52 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  31.78 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  32.77 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  28.37 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  29.6 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  35.25 
 
 		 146 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  38.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  37.93 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  40.24 
 
 		 168 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  23.91 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  38.82 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  36.47 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  38.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  29.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  39.02 
 
 		 173 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  29.41 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>