29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1137 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  68.97 
 
 		 164 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  74.64 
 
 		 136 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  70.29 
 
 		 136 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  67.39 
 
 		 132 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  61.15 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  62.12 
 
 		 128 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  32.79 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  29.5 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  30.15 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  38.33 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.67 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  36.67 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  35.14 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  29.11 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.06 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  27.63 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  26.15 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  37.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  31.65 
 
 		 425 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  26.77 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  31.17 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  27.78 
 
 		 151 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  27.85 
 
 		 156 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  29.87 
 
 		 173 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  30.12 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>