19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0417 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  9e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  99.36 
 
 		 156 aa  320  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  75 
 
 		 190 aa  244  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0593  hypothetical protein  39.61 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0633  hypothetical protein  38.56 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1024  hypothetical protein  41.35 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  31.06 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  30.2 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0725  hypothetical protein  29.6 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  28.79 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  27.63 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  29.66 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  26.87 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  26.06 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  23.74 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  32.86 
 
 		 168 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>