30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2464 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  65.67 
 
 		 132 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  61.15 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  62.04 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  63.49 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  60.58 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  61.31 
 
 		 164 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  37.69 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  28.89 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  36.07 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  36.07 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.07 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  32.77 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  36.25 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  36.07 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  28.8 
 
 		 425 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  34.43 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  43.1 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  38.36 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.06 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  35.14 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  26.98 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  31.65 
 
 		 156 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  32.47 
 
 		 173 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  30.12 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  34.09 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0633  hypothetical protein  24.22 
 
 		 152 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>