18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2479 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  100 
 
 
146 aa  287  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  37.69 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  37.06 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  37.12 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  37.01 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  37.82 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  37.01 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  32.79 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  36.89 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  36.89 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  32.46 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  34.95 
 
 
183 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  35.25 
 
 
219 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  33.58 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  30.86 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  31.03 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  28.99 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>