31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0623 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  78.74 
 
 		 132 aa  203  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  66.92 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  66.15 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  70.16 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  63.49 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  62.12 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  37.01 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  30.95 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  40 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  33.04 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  38.33 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  28.79 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  28.79 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  36.71 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  36.51 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  35.71 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  33.9 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  31.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  34.18 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  36.84 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  35.71 
 
 		 425 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  31.65 
 
 		 144 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0593  hypothetical protein  24.3 
 
 		 152 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  34.62 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0633  hypothetical protein  24.3 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  28.57 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>