43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1189 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  100 
 
 		 142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  79.23 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  69.89 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  61.46 
 
 		 173 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  60.42 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  62 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  38.69 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  53.09 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  43.48 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  37.24 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  35.42 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  36.15 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  45.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  45.83 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  39.13 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  42.53 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  41.3 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  37.76 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  40 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  35.05 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  38.04 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  36.26 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  35.79 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  34.15 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  31.82 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  34.12 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  34.12 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  35.35 
 
 		 430 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  31.16 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  34.78 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  39.39 
 
 		 425 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  32.94 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  32.94 
 
 		 180 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  32.94 
 
 		 196 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  29.03 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  31.87 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1381  hypothetical protein  28.92 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  31.67 
 
 		 286 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>