26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1843 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  46.53 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  40.79 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  38.41 
 
 		 156 aa  93.6  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  39.6 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  38.85 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  40.67 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  36.3 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  41.07 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  40.74 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  40.74 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  37.96 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  35.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  32.35 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  32.12 
 
 		 286 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  31.39 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  35.42 
 
 		 425 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.96 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  30.66 
 
 		 286 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  30.34 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  30.11 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  29.03 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  28.87 
 
 		 150 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  28.87 
 
 		 150 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  27.66 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>