66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1122 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  100 
 
 
153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  58.22 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  48.55 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  53.02 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  45.32 
 
 
156 aa  123  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  57.14 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  57.14 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  49.11 
 
 
162 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  40.67 
 
 
150 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  48.18 
 
 
165 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  43.41 
 
 
430 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  43.92 
 
 
145 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  40.95 
 
 
425 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  35.25 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  35.25 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  32.82 
 
 
266 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  38.46 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  34.4 
 
 
296 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  35.16 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  33.6 
 
 
286 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  34.68 
 
 
285 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  35.79 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2778  hypothetical protein  39.02 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.832205  normal  0.295065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  32.8 
 
 
286 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  34.07 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  40.95 
 
 
316 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  34.07 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  33.94 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  54 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  46.88 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  55.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  55.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  55.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  55.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  55.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  55.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  46.88 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  53.06 
 
 
208 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  30.56 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  30.56 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  53.33 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  45 
 
 
177 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  34 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  50 
 
 
216 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  58.54 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  51.11 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  51.11 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  51.11 
 
 
216 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  58.54 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  26.95 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  38.03 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  45.24 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2289  17 kDa surface antigen  34.95 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.0439571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0944  17 kDa surface antigen  26.42 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  55.81 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  26.24 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  43.64 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  43.64 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  43.64 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  43.64 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  43.64 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  29.21 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  29.21 
 
 
228 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  29.21 
 
 
228 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  47.73 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>