33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0896 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  52.58 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  52.58 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  51.58 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  41.73 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  51.55 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  40.3 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  36.57 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  44.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  38.3 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  40.7 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  29.87 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  35.19 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  33.64 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  34.58 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  33.64 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  43.9 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  36.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  34.51 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  36 
 
 		 425 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  28.38 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  32.77 
 
 		 430 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  28.19 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  29.49 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  29.11 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  29.11 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  38.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  29.21 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  25.71 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>