31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1068 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  94.29 
 
 
141 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  59.86 
 
 
148 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  55.15 
 
 
139 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  46.15 
 
 
161 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  46.15 
 
 
161 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  47.45 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  45.78 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  47.19 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  35.21 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  39.29 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  35.64 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  35.87 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  35.87 
 
 
173 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  34.78 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  35.35 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  32.67 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  27.08 
 
 
156 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  29.25 
 
 
145 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  28.86 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  28.86 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  31.91 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  34.33 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  31.76 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  31.87 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  29.03 
 
 
425 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  30.43 
 
 
154 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  30.28 
 
 
430 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>