34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3178 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  100 
 
 		 145 aa  293  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  44.96 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  39.1 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  40 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  41.22 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  47.92 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  48.86 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  45.65 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  45.65 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  44.79 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  34.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  41.84 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  39.8 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  39.8 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  36.72 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  43.02 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  29.61 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  32.67 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  30.39 
 
 		 266 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  30.21 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  28.43 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  31.78 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  35.63 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  26.73 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  34.48 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  34.83 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  34.83 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  29.71 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  31.68 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  28.43 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  28.86 
 
 		 430 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  27.01 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>