37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4294 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  97.22 
 
 		 180 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  85.41 
 
 		 183 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  58.43 
 
 		 163 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  65.96 
 
 		 166 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  62.89 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  40.56 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  32.85 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  32.59 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  35.04 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  32.35 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  33.82 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  28.26 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  36.67 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  36.67 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  39.51 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  38.82 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  32.95 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  28.89 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  36.47 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0633  hypothetical protein  27.21 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  34.92 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  34.83 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  28.24 
 
 		 156 aa  44.7  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  28.89 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0593  hypothetical protein  27.14 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  36.14 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  32.94 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  28.09 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  32.14 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  26.97 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  27.27 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>