35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1308 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  89.63 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  75.74 
 
 		 136 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  74.64 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  70.59 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  66.15 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  62.04 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2479  putative signal peptide  37.12 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0489634  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  32.81 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  36.67 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  35 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  35 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0417  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0425  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2101  hypothetical protein  36.67 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0533  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  29.6 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  37.5 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  33.77 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  39.29 
 
 		 425 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0593  hypothetical protein  28.23 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  31.94 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  30.12 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0633  hypothetical protein  28.23 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  32.53 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  29.87 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  29.63 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  34.52 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  30.16 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  33.93 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>