34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0632 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  61.27 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  58.45 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  55.48 
 
 		 139 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  51.82 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  53.38 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  53.38 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  54.02 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  38.69 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  42.64 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  42.86 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  40.86 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  40.22 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  39.78 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  31.82 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  39.22 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  29.25 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  31.9 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  36.56 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  38.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  38.55 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  31.39 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  34.04 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  30.87 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  30.87 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  31.91 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  30.11 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  32.69 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  37.31 
 
 		 430 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  40.3 
 
 		 425 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  29.41 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>