34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0351 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  100 
 
 
155 aa  319  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  46.53 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  36.73 
 
 
156 aa  89  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  34.75 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  45.74 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  42.11 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  43.3 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  35.46 
 
 
430 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  36.54 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  32.59 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  32.59 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  33.68 
 
 
425 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  29.93 
 
 
266 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  35.71 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  34.41 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  35.65 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  38.02 
 
 
316 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  31.58 
 
 
285 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  30.43 
 
 
286 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  30.43 
 
 
296 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  30.43 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  37.5 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  30.56 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  34.38 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0944  17 kDa surface antigen  26.77 
 
 
346 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  28.48 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.24 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  34.23 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  34.23 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  35.8 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>