133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44406 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  100 
 
 
1782 aa  3702    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  33.77 
 
 
370 aa  150  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  30.77 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  28.92 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  28.94 
 
 
361 aa  85.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  25 
 
 
349 aa  84.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  26.53 
 
 
356 aa  80.1  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.42 
 
 
369 aa  79  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  25.97 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  30.09 
 
 
338 aa  77.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  27.81 
 
 
403 aa  77.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  27.96 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  26.69 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  25 
 
 
392 aa  74.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.78 
 
 
372 aa  73.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  26.98 
 
 
385 aa  73.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.61 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.44 
 
 
349 aa  70.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.57 
 
 
355 aa  70.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.2 
 
 
359 aa  70.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  25.13 
 
 
387 aa  71.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  26.35 
 
 
391 aa  70.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  24.25 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.25 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  24 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  26.97 
 
 
376 aa  67.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.29 
 
 
322 aa  67.4  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  24.05 
 
 
387 aa  66.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  25.75 
 
 
313 aa  65.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  24.79 
 
 
385 aa  65.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  25.15 
 
 
383 aa  65.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  25.15 
 
 
383 aa  65.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  25.15 
 
 
383 aa  65.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  24.65 
 
 
418 aa  65.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.14 
 
 
405 aa  65.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.23 
 
 
321 aa  63.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.58 
 
 
382 aa  63.9  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  23.45 
 
 
391 aa  63.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  26.49 
 
 
384 aa  63.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  23.96 
 
 
363 aa  63.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  24.43 
 
 
391 aa  62.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  23.68 
 
 
405 aa  62.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  24.94 
 
 
388 aa  62  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  23.1 
 
 
388 aa  60.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  27.54 
 
 
348 aa  60.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  25.86 
 
 
403 aa  59.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  27.49 
 
 
328 aa  59.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  24.26 
 
 
399 aa  58.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.67 
 
 
387 aa  58.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  27.71 
 
 
388 aa  58.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  47.37 
 
 
290 aa  57.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  25.95 
 
 
388 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  24.27 
 
 
397 aa  58.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.03 
 
 
387 aa  57  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  23.71 
 
 
301 aa  56.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  27.75 
 
 
381 aa  55.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  25.8 
 
 
382 aa  55.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  22.71 
 
 
383 aa  55.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  25.85 
 
 
394 aa  55.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  24.1 
 
 
383 aa  55.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  25.36 
 
 
388 aa  55.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  22.86 
 
 
386 aa  55.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  24.48 
 
 
414 aa  54.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  24.38 
 
 
399 aa  54.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  23.1 
 
 
393 aa  54.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  22.74 
 
 
395 aa  54.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  23.34 
 
 
398 aa  53.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  27.1 
 
 
381 aa  53.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  22.46 
 
 
386 aa  53.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  28.45 
 
 
381 aa  53.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  28.65 
 
 
381 aa  53.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  28.65 
 
 
381 aa  53.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  28.65 
 
 
381 aa  53.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  28.65 
 
 
381 aa  53.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  21.78 
 
 
386 aa  52.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  23.17 
 
 
385 aa  52.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  30.67 
 
 
314 aa  52.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  27.83 
 
 
330 aa  52.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  23.15 
 
 
355 aa  52.4  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  23.51 
 
 
382 aa  52  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3653  galactokinase  29.19 
 
 
434 aa  51.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  27.23 
 
 
310 aa  52  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  24.4 
 
 
382 aa  52  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  38.67 
 
 
289 aa  51.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  22.79 
 
 
386 aa  52  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  28.02 
 
 
314 aa  51.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  23.51 
 
 
382 aa  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  23.8 
 
 
382 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  34.48 
 
 
303 aa  51.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  29.44 
 
 
381 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  24.43 
 
 
400 aa  51.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  23.8 
 
 
382 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  23.8 
 
 
382 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  23.87 
 
 
382 aa  51.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  23.8 
 
 
382 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  27.41 
 
 
343 aa  50.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  23.77 
 
 
396 aa  50.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  23.8 
 
 
382 aa  50.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  23.24 
 
 
382 aa  50.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  23.24 
 
 
382 aa  50.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>