185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0780 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  99.48 
 
 		 382 aa  788    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  90.84 
 
 		 382 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  90.84 
 
 		 382 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  91.1 
 
 		 382 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  99.48 
 
 		 382 aa  788    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  89.79 
 
 		 382 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  91.36 
 
 		 382 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  99.21 
 
 		 382 aa  786    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  99.48 
 
 		 382 aa  788    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  90.84 
 
 		 382 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  98.69 
 
 		 382 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  99.48 
 
 		 382 aa  788    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  100 
 
 		 382 aa  792    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  74.15 
 
 		 383 aa  581  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  71.84 
 
 		 383 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  72.58 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  72.58 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  72.58 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  70.79 
 
 		 383 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  65.08 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  65 
 
 		 387 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  64.29 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  64.55 
 
 		 386 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  61.39 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  61.11 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  60.53 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  59.47 
 
 		 387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  59.84 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  54.72 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  50.95 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  50.68 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  49.87 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  49.07 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  49.33 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  48.83 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  47.21 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  49.07 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  47.66 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  45 
 
 		 385 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  45.65 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  44.02 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  42.97 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  42.97 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  42.97 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  42.97 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  42.86 
 
 		 382 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  42.11 
 
 		 381 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  42.37 
 
 		 381 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  41.91 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  42.37 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  41.64 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.56 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  42.35 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  43.54 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  41.09 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  42.82 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.71 
 
 		 385 aa  292  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  47.72 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.15 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  38.68 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  39.79 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  39.31 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  40 
 
 		 389 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.82 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  44.51 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  41.38 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  42.74 
 
 		 414 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  44.85 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.09 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.52 
 
 		 388 aa  268  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  39.31 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.31 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.32 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  40.54 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  38.36 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.73 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.49 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  37.05 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.9 
 
 		 389 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  40.84 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.37 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  39.94 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.29 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  42.09 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  34.76 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  41.16 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  38.96 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  41.46 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  38.58 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.8 
 
 		 386 aa  238  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  40.18 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  39.07 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.5 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.29 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  37.05 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  35.88 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.86 
 
 		 392 aa  232  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  39.64 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  38.52 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  37.98 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>