121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2213 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  100 
 
 
289 aa  592  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  70.83 
 
 
289 aa  417  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  66.78 
 
 
290 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  71.53 
 
 
289 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  69.1 
 
 
289 aa  381  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  42.76 
 
 
301 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  40.66 
 
 
303 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  41.48 
 
 
321 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  37.14 
 
 
322 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  34.94 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  34.51 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  36.96 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  37.57 
 
 
330 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  33.23 
 
 
313 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  36.39 
 
 
336 aa  128  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  37.62 
 
 
328 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  35.44 
 
 
309 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  32.69 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  30.3 
 
 
313 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  31.5 
 
 
314 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  28.57 
 
 
356 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  31.69 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  32.17 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  30.09 
 
 
310 aa  98.6  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  29.13 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  29.13 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  28.04 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.15 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  33.08 
 
 
276 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  28.36 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.5 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  29.63 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  26.43 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  31.32 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  33.92 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  30.66 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  30.32 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  30.18 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  30.25 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.27 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  31.86 
 
 
735 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.88 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  24.87 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  30.29 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  28.87 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  28.52 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  24.83 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  28.86 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  28.86 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  31.33 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  27.58 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  28.42 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.98 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.07 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  26.16 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  28.69 
 
 
900 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  29.96 
 
 
359 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  24.85 
 
 
375 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  26.25 
 
 
357 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  26.88 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  31.89 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  25.14 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  23.93 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  45.71 
 
 
488 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  28.57 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  26.95 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  24.23 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  29.57 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  26.02 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.89 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  27 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.49 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  27.08 
 
 
490 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  26.78 
 
 
370 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  26.05 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  24.77 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  25.44 
 
 
408 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  24.14 
 
 
358 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  25.83 
 
 
372 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  23.69 
 
 
398 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  25.7 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  27.64 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  25.18 
 
 
388 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  25.82 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.71 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.71 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  27.45 
 
 
779 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  25.51 
 
 
383 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  23.01 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  23.51 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  29.93 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  23.38 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  25 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  31.16 
 
 
354 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  24.5 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0215  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.16 
 
 
283 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000188115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  28.39 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  32.94 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  23.4 
 
 
358 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  26.42 
 
 
414 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>