217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2604 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  100 
 
 
327 aa  639    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  77.74 
 
 
330 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  72.7 
 
 
328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  71.73 
 
 
328 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  69.94 
 
 
338 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  40.96 
 
 
321 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  37.08 
 
 
301 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  37.84 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  34.95 
 
 
290 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  36.62 
 
 
336 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  35.93 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  34.04 
 
 
289 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  34.94 
 
 
289 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  35.84 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  32.79 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  30.54 
 
 
313 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  35.67 
 
 
315 aa  123  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  34.04 
 
 
289 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  32 
 
 
313 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  35.9 
 
 
310 aa  122  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  29.93 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  30.32 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  32.06 
 
 
309 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  34.52 
 
 
314 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  30.07 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  29.74 
 
 
306 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  30 
 
 
317 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  30.93 
 
 
289 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  32.96 
 
 
356 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  33.01 
 
 
314 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  30.63 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  28.53 
 
 
361 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  32.34 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  28.52 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.12 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  26.89 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.12 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  28.24 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  27.35 
 
 
735 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  28.28 
 
 
316 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  28.48 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  30.6 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  29.84 
 
 
490 aa  85.9  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27.65 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  27.24 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  29.03 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  23.56 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  26.74 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  23.81 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  27.5 
 
 
900 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.15 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  26.97 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  24.77 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  24.93 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  27.79 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  28 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  26.49 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  26.94 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  26.4 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  28.45 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.49 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  28.7 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  29.65 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  26.13 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  28.19 
 
 
286 aa  67  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  27.35 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  26.19 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.74 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  21.52 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  26.02 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  29.82 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  23.51 
 
 
393 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  22.22 
 
 
387 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  32.81 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  22.22 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  30.57 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  23.88 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  25.52 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  25.52 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  25.95 
 
 
386 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  26.36 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  30.34 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  23.17 
 
 
383 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  24.93 
 
 
388 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  28.78 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  23.55 
 
 
387 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  26.51 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  25.8 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  29.71 
 
 
407 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  21.99 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  26.51 
 
 
397 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  27.12 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  26.78 
 
 
400 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  28.66 
 
 
401 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  25.6 
 
 
394 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  27.12 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  26.8 
 
 
403 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  26.84 
 
 
1782 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  23.85 
 
 
375 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  23.72 
 
 
395 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>