70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1835 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  66.02 
 
 
314 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  68.28 
 
 
314 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  64.61 
 
 
315 aa  391  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  42.8 
 
 
336 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  33.47 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  35.9 
 
 
327 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  35.28 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  33.46 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  34.42 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  32.27 
 
 
314 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  31.4 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  29.72 
 
 
309 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.37 
 
 
313 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.37 
 
 
313 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  34.95 
 
 
330 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  36.19 
 
 
328 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  34.11 
 
 
338 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  29.1 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.35 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.92 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  32.76 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  33.1 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  26.79 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  25 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  25.82 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.92 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  25.81 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  28.34 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  27.12 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  27.12 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  30.18 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.93 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  25 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  27.99 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  32.87 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  25.66 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  27.24 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  22.11 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  26.74 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  31.82 
 
 
289 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  23.05 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.14 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.05 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  28.44 
 
 
354 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  27.22 
 
 
900 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  27.23 
 
 
1782 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  27.74 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  23.86 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  28.08 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  29.27 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  26 
 
 
735 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  22.67 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  29.41 
 
 
382 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  23.78 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  24.85 
 
 
400 aa  46.6  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  31.75 
 
 
373 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  21.83 
 
 
380 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  23.87 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  21.21 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.56 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  25.61 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  23.56 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  22.64 
 
 
432 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  27.88 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  25.26 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  25.25 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  27.92 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25 
 
 
375 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>